במערכת הביטחון נערכו לחג רמדאן נפיץ במיוחד על רקע היקף ההתרעות החמות שהציג השב"כ לביצוע פיגועים וההסתה ברשתות החברתיות. ראש אמ"ן האלוף אהרון חליוה התריע על "הר הבית כנפץ" שעלול לשמש לדלק שישלב בין הזירות השונות מצפון, איו"ש ודרום. מנגד, הפעילו פיקוד המרכז ומתאם פעולות הממשלה בשטחים והמנהל האזרחי מאמצים גדולים לאפשר חופש פולחן וחופש תנועה בצירי איו"ש ועוטף ירושלים, כדי לאפשר את תפילות יום השישי במסגד אל אקצא.
בסך כל ימי שישי לאורך הרמדאן וציון לילת אל קאדר הגיעו כ-400,000 מתפללים פלסטינים אל ההר. התפילות התנהלו באווירה של הסלמה ביטחונית. אירעו כ-50 מקרי טרור שכללו פיגוע דריסה אחד ופיגועי ירי באיו"ש, מטחי רקטות מרצועת עזה ומלבנון וכלי טיס איראני שחדר מסוריה לישראל. מנגד, מתחילת השנה סיכל השב"כ למעלה מ-220 פיגועים משמעותיים, בהם כ-150 פיגועי ירי, 20 פיגועי מטען, פיגועי דריסה, התאבדות, וחטיפה אזרחים. חלק משמעותי מהסיכולים בוצע במהלך רמדאן.
מניתוח האירועים השונים עולה כי הפיגועים בתקופת הרמדאן היו המשך ישיר להיקף הטרור וההסתה מתחילת השנה אך האירוע הבולט ביותר היתה הפריצה של שוטרי מחוז ירושלים אל המסגד ומעצר של צעירים אלימים בשילוב הפצת סרטון ברשת שכלל לא היה מהתקופה כעת הפך לדלק להסתה וגרר גינויים רבים.
מדברי גורמי ביטחון עולה כי חמאס עמד מאחורי מרבית ההסתה ברשתות החברתיות, והיווה הגורם המרכזי שהסית את הצעירים להתפרע בהר הבית. מתחקור של העצורים שבוצע על ידי רכזי השב"כ בשטח, עלה כי כמעט כל אלו שהתבצרו במסגד אל-אקצא במהלך הפריצה של המשטרה בערב החג הראשון הם צעירים בגילאי 25-22, שהושפעו מההסתה השקרית שחמאס הפיץ ברשת לגבי שינוי סטטוס קוו בהר הבית. בפן העובדתי לא שונה אף נוהל.
עוד עלה מהחקירה כי כל הצעירים האלימים במסגד לא היו דתיים שבאו להתפלל. על פי ניתוח החקירות והממצאים בשטח, אם השוטרים לא היו פורצים למסגד בלילה, המתבצרים היו מתפרעים בבוקר והשילוב של אירוע אלים בתוך המסגד עם הגעת היהודים ויחד עם עשרות אלפים מוסלמים שהגיעו להר הבית היה מוביל להידרדרות נוספת של המרחב לאירוע דרמטי הרבה יותר עם פוטנציאל נפגעים גדול משני הצדדים.
למרות הרמדאן רף ההתרעות הגבוה לא חלף. במערכת הביטחון, מסמנים את צפון השומרון כאזור מחולל הטרור וההתרעות מספר אחת. מנגנוני הביטחון הפלסטינים כמעט ולא פועלים שם למעט פעילות נקודתית מאוד בשבוע האחרון נגד פעילי גיהאד אסלאמי בג'נין, שגררה אחריה ירי של חמושים לעבר המוקטעה בעיר. המעצרים והכניסות של צה"ל ושב"כ, כמו זאת ביום שלישי במחנה הפליטים ג'נין, מסכלות פיגועים על בסיס יומי. עיקר החשש הוא מפני פיגוע גדול, ולכן אוגדת יו"ש עדיין מתוגברת בשלושה גדודים ולקראת יום הזיכרון ויום העצמאות תתוגבר בעוד כמה פלוגות לוחמים.