בתקופה האחרונה הצביע השב"כ על כמה חוליות טרור בקלקיליה שמתכוונות לבצע פיגועי ירי, כשבהתאם לכך ביצעה אוגדת יהודה ושומרון בפיקודו של תא"ל יקי דולף כמה פעולות בלב העיר הפלסטינית. באחד הלילות, לפני כשבוע וחצי, נהרגו ארבעה מחבלים מאש צה"ל. לאחר מכן, ביצעו כוחותינו כמה כניסות במטרה לאתגר את החמושים המקומיים ולפגוע בהם.
בנוסף, לפי ההערכות, היקף החמושים בקלקיליה קטן מזה שבמחנות הפליטים בטול כרם ובג'נין, אולם מתבצע ללא ספק ניסיון לחקות את דפוסי הפעולה ולהוציא אל הפועל פיגועים. זאת, לרבות שימוש בירי, מטעני חבלה ובקבוקי תבערה.
"הניסיון לסחוף צעירים הוא בלתי פוסק", אמר גורם ביטחוני, שמייחס חשיבות רבה למצוקה הכלכלית ביהודה ושומרון על רקע אי כניסת פועלים פלסטינים לעבודה בישראל ובהתיישבות. "לאחרונה נפתח מעבר ג'למה לכניסת ערבים ישראלים לג'נין. זה קצת מקל ומכניס כסף אבל המגמה היא שלילית. יש מצוקה כלכלית גדולה, אין אופק כלכלי ברחוב".
עוד הוסיף הגורם הביטחוני כי התוכנית של שר האוצר בצלאל סמוטריץ' ואחרים למנוע את כספי הסילוקין מהרשות הפלסטינית יכולה להביא לקריסת מנגנוני הביטחון הפלסטינים, כמו גם מערכות מתפקדות בתוך הרשות הפלסטינית. "צעדים נגד הרשות הפלסטינית רק יחריפו את המצב בגזרה".
לדברי גורמי ביטחון, בשונה מערים אחרות, מנגנוני הביטחון הפלסטינים בקלקיליה אגרסיביים בהרבה מערים אחרות, ובכל זאת, תשתיות טרור מחו"ל מצליחות להזרים כסף גדול לחוליות מקומיות בתמורה לפיגועים. "בניגוד לכניסות האלימות לג'נין וטול כרם, הפעילות בקלקיליה לא גוררת אחריה את החמושים החוצה ולא את הצעירים לקיים הפרות סדר, ובכל זאת יש כניסות בתדירות מאוד גבוהה כדי לא לאפשר לטרור לצמוח", אמר גורם צבאי לוואלה.
בשבת בבוקר נרצח בקלקיליה אמנון מוכתר מפתח תקווה, במה שלדברי גורמים בצה"ל מסתמן כפיגוע על רקע לאומני. מוכתר נורה למוות ברכבו, שהוצת לאחר הירצחו.
מחקירה ראשונית עלה כי היה מוכר לסוחרים בעיר הפלסטינית, בה נהג לערוך קניות של פירות וירקות. על פי תמונות מהזירה, לאחר שנורה רכבו הוצת ורישיון הנהיגה שלו נלקח. עוד עלה מפרטים ראשוניים כי מוכתר נכנס לעיר הבוקר דרך מעבר אליהו. בקלקיליה כמו גם בערים פלסטיניות נוספות באיו"ש אין מחסום בידוק לבאים לעיר, אולם קיים שילוט במרחב האוסר על ישראלים להיכנס לשטח A.