כל הלוחמים ביחידת דובדבן טענו כי לא ירו לעבר עיתונאית אל-ג'זירה שירין אבו עאקלה או זיהה אותה בפעילות צה"ל בג'נין - כך לפי תחקיר ראשוני שנערך הערב (רביעי) ביחידה. עוד עולה מהתחקיר כי העיתונאית שנהרגה הבוקר בחילופי אש במחנה הפליטים בעיר ככל הנראה עמדה באזור ממנו ירו פלסטינים חמושים לעבר הכוחות.
מהתחקיר הראשוני עלה כי כוחות צה"ל ירו במדויק לעבר החמושים בג'נין, זאת תוך פירוט מספר הקליעים שנורה על ידי החיילים ומיקומם בשטח. כמו כן, עלה מניתוח התיעוד של חילופי האש בזירה כי כאלף קליעים נורו על ידי החמושים הפלסטינים לעבר הלוחמים, ממגוון אמצעי לחימה שהיו במצב "אוטומט".
בשלב זה, בצה"ל לא שוללים את הטענה לפיה הלוחמים פגעו בעיתונאית בשוגג - בין אם הקליע שהרג אותה חדר קיר או שמא קליע שכוון ופגע במחבל המשיך במסלול בליסטי לעברה.
עוד בנושא מות עיתונאית אל-ג'זירה בחילופי אש בג'נין
בתוך כך, בעקבות הביקורת החריפה בזירה הבינלאומית על הרג העיתונאית, צה"ל צמצם הלילה את הפעילות ההתקפית בשטחים, הכוללת מעצרים של חשודים בפעילות טרור.
גורם צבאי העריך הבוקר כי "הביקורת החריפה על צה"ל בעקבות האירוע במחנה הפליטים בג'נין, ההאשמות התלושות וההסתה הקיצונית עלולים להצית גל נוסף של טרור. מדובר באתגר נוסף לכוחות הצבא. אוגדת יו"ש נערכת בקרוב לקלוט את גדודי המילואים שיחליפו חלק מכוחות הסדיר שיתפנו לאימונים או לתרגיל המטכ"לי".
הגורם הוסיף, כי התחקיר שמקיים ביממה האחרונה מפקד חטיבת הקומנדו, מני ליברטי, על הפרשה במחנה הפליטים ג'נין יוצג ככל הנראה בשבוע הבא למפקד אוגדת יו"ש, אבי בלוט, ולאחר מכן למפקד פיקוד המרכז יהודה פוקס. "יש עדיין לא מעט השלמות לבצע, למרות שבוצע תחקיר פרטני לכלל הלוחמים שלקחו חלק בפעילות", הסביר גורם המצוי בפרטים.
לפי דיווחים, חילופי האש התפתחו בין הצדדים לאחר שצה"ל כיתר בית בו התבצרו חמושים. משרד הבריאות הפלסטיני ציין כי אבו עאקלה, כתבת מוכרת שפעילה כבר במשך 20 שנה, מתה מפצעיה לאחר שנורתה בראשה והוגדרה תחילה כפצועה קשה. העיתונאי השני שנפצע הוא עלי סמודי, שהיה במשך שנים כתב וצלם של סוכנות הידיעות הבריטית רויטרס.
הרמטכ"ל אביב כוכבי הביע צער על מותה של העיתונאית והוסיף כי יוקם צוות מיוחד שיחקור את המקרה. מוקדם יותר פרסם צה"ל סרטון בו נראים חמושים מתפארים בירי בחייל, מה שלטענת הצבא מעלה את החשד לפגיעה בעיתונאית דווקא מצד הפלסטינים.
"במהלך פעילות הלילה, כמו באירועים רבים אחרים, התבצע על ידי הפלסטינים ירי נרחב לעבר כוחותינו, ירי פראי וחסר הבחנה לכל כיוון", טען הרמטכ"ל. "בניגוד לפלסטינים, חיילי צה"ל מבצעים ירי מקצועי וסלקטיבי. הכתבת שנהרגה שהתה בזירת לחימה. בשלב זה לא ניתן לקבוע מאיזה ירי היא נפגעה ואנו מצטערים על מותה".