ראש המוסד יוסי כהן שיגר היום (ראשון) באמצעות מנהלת לשכתו מכתב תגובה לפניה של התנועה לאיכות השלטון, בה הצהיר כי "אין קשר פוליטי בין ראש המוסד לראש הממשלה או מפלגת הליכוד. כל הפעולות נעשות אך ורק לשם שמירה על ביטחונם של מדינת ישראל ועם ישראל, ללא קשר לזהות העומד בראשות הממשלה".
זאת, בעקבות דרישה שהוציאה אמש התנועה ובה ביקשה להבהיר את דבריו של ראש הממשלה בנימין נתניהו בריאיון בחדשות 13. בריאיון אמש נתניהו אמר כי לאחר פרישתו של כהן "בממשלה שאקים אדאג לשלב אותו בתפקיד. אדע לנצל את כישוריו".
עוד בוואלה!
לאחר דברי נתניהו, התנועה לאיכות השלטון שלחה מכתב לכהן וליועץ המשפטי לממשלה אביחי מנדלבליט ובו אותה דרישה לפרסום הבהרה כי לראש המוסד אין קשר פוליטי עם ראש הממשלה או עם הליכוד. "עצם אמירתו של ראש הממשלה - אמירה מצערת אשר יש בה ולו רק לרמוז שמא מתקיימים יחסים פוליטיים בין ראש המוסד לבין ראש הממשלה - יש בה עד כדי חילול הקודש של ממש, ופגיעה חמורה ביותר ביכולתו של ארגון חשוב זה לפעול כמשרתו של הציבור במדינת ישראל", נכתב.
"נבקש כי תוציא באופן בהול הבהרה - בין אם בשמך, ובין אם בשם הארגון עליו אתה מפקד - לפיה אין ולא קיים כל קשר פוליטי בינך לבין ראש הממשלה או מפלגת הליכוד, וכי כל פעולותיך נעשות אך ורק לשם שמירה על בטחונה של מדינת ישראל ושל עם ישראל, וללא קשר לזהות העומד בראשות הממשלה", ציינו במכתב.
כהן אמור לסיים את כהונתו בראשות המוסד בחודש יוני, ונחשב למקורב מאוד לנתניהו. חוק הצינון מונע מראש המוסד ובכירים אחרים במערכת הביטחון להתמודד לכנסת ולהתמנות לתפקיד שר במשך שלוש שנים מיום סיום תפקידם. בעבר שמו של כהן הוזכר כמועמד לשגריר בארצות הברית או כשליח מיוחד של נתניהו לנושאים מדיניים.
כהן, ראש המוסד מאז 2016, שימש קודם כראש המל"ל ונחשב למקורב מאוד גם לרעייתו של נתניהו - וכמי ששוקל קריירה פוליטית בעתידו. באוגוסט 2019 נחשף בוואלה! כי בשיחות סגורות נתניהו סימן את כהן, וכן את השגריר לשעבר בארצות הברית רון דרמר, כיורשים ראויים למלא את נעליו ואמר ש"הם המתאימים להנהיג את מדינת ישראל" ביום שאחריו.
כהן נחשב לאחד מאדריכלי המאבק הישראלי בגרעין האיראני בשנים האחרונות וכן שיחק תפקיד מרכזי בהסכמי הנורמליזציה עם מדינות המפרץ, מה שהוביל בשנה האחרונה ללא מעט מאבקי כוח בינו ובין ראש המל"ל, מאיר בן שבת, שגם ממונה על הנושאים הללו מטעמו של נתניהו.