התרסקות המסוק מסוג קוברה הלילה (שלישי) באזור רבדים שליד גדרה היא האחרונה בשורת תאונות בחיל האוויר בשנים האחרונות. בחודש ספטמבר 2008 התרסק גם כן מסוק קוברה בעמק יזרעאל. בהתרסקות נהרגו שני טייסי מילואים מנוסים. התרסקות המסוק הקטלנית האחרונה שנרשמה בחיל האוויר אירעה במהלך טיסת אימונים בהרי הקרפטים ברומניה בחודש יולי 2010. כתוצאה מההתרסקות על צלע ההר, נהרגו שישה אנשי צוות מחיל האוויר ומשקיף מצבא רומניה.
בחודש אוקטובר 2008 התרסק מטוס האימונים "צוקית" בחולות צאלים. מדריך וחניך נהרגו בהתרסקות. בחודש ספטמבר שנת 2009, התרסק מטוס F-16a שהמריא מבסיס נבטים ובו אסף רמון, בנו של האסטרונאוט הישראלי הראשון אילן רמון, בעת שהיה בטיסת אימונים. בחודש נובמבר 2010 נהרגו טייס ונווט בהתרסקות מטוס F-16i המכונה "סופה" סמוך למצפה רמון.
במהלך מלחמת לבנון השנייה בשנת 2006 נהרג הטייס רס"ן רן יהושע-כוכבא בהתנגשות מסוקי אפאצ'י סמוך לקריית שמונה. שלושה נפצעו קשה באותה התקרית. ארבעה ימים לאחר מכן התרסק מסוק אפאצ'י בגליל העליון בזמן שהיה בדרכו לסייע לכוחות הקרקעיים באזור בינת ג'בל. בהתרסקות נהרגו אל"מ צבי לופט וסגן תם פרקש. כחודש לאחר מכן, בשלהי המלחמה, מסוק "יסעור" הופל על ידי חיזבאללה. רס"ל קרן טנדלר, רס"ן סמי בן נעים, רס"ן במילואים ניסן שלו, סרן דניאל גומז ורס"ל מתקדם רון משיח נהרגו באירוע.
בשנת 2000 נהרגו יונתן בגין, בנו של בני בגין ונכדו של מנחם בגין, וליאור הררי בהתרסקות מטוס אף-16 במהלך טיסת אימון כ-30 ק"מ מחוף עתלית.
האסון הקשה ביותר שפקד את חיל האוויר הישראלי היה אסון המסוקים בחודש פברואר 1997, בו נהרגו 73 חיילים. שני מסוקי יסעור התנגשו מעל עמק החולה בעת שהובילו לוחמים למוצבי צה"ל בדרום לבנון. האסון החמור ביותר שקדם לאסון המסוקים היה אסון הנ"ד במאי 1977, אז נהרגו 54 חיילים בהתרסקות מסוק תובלה בבקעת הירדן, במהלך תרגיל עוצבתי משולב בבקעה. דקות ספורות לאחר ההמראה הנמיך המסוק עד שפגע במדרון של גבעה והתרסק. התרגיל המשיך גם לאחר התאונה.
בחיל האוויר מקפידים על רמת בטיחות מהגבוהות בעולם ועורכים כנסים מיוחדים כדי למנוע את מקרי הקיצון אך למרות זאת נרשמו בשנתיים האחרונות תאונות של כמעט ונפגע. בינואר האחרון נטשו טייס ונווט בעת הנחיתה לאחר שזיהו תקלה טכנית במטוס. ביולי 2012, במהלך תדלוק של מטוס סופה על ידי מטוס ראם, התנתק מוט התדלוק וכמעט נגרם אסון לאחר שמטוס הקרב נפגע. בספטמבר 2012 שני תא"לים שהטיסו מטוסי קרב חלפו אחד על ידי השני וכמעט התנגשו. בספטמבר 2009 נאלץ מטוס F-16 לבצע נחיתת חירום בבסיס רמון עקב תקלה במנוע.