דובר צה"ל הגיב הערב (חמישי) לפגיעה בכנסיית הקתולית ברצועת עזה וכתב בהודעה כי "על פי בדיקה ראשונית שנערכה בעקבות דיווחים על נפגעים בכנסייה הלטינית בעיר עזה, עלה כי רסיסים מפגז שנורה במהלך פעילות מבצעית במרחב פגעו בשוגג בכנסייה. מקור האירוע מצוי בבדיקה, והאירוע מתוחקר. צה"ל מכוון את תקיפותיו לעבר מטרות צבאיות בלבד ופועל ככל שניתן לצמצום הפגיעה באזרחים ובמבני דת. צה"ל מצר על כל פגיעה שאירעה שלא במכוון".
בתוך כך, ראש הממשלה, בנימין נתניהו, התייחס בהודעה באנגלית לאירוע וזאת לאחר שנשיא ארצות הברית, דונלד טראמפ, התקשר אליו. לפי דוברת הבית הלבן, תגובתו לא הייתה חיובית.
"ישראל מביעה צער עמוק על כך שפגיעת תחמושת תועה פגעה בכנסיית המשפחה הקדושה בעזה", כתב נתניהו הודעה באנגלית שיצאה מלשכתו. "כל אובדן של חיי חפים מפשע הוא טרגדיה. אנו שותפים לצערן של המשפחות ושל בני הקהילה. אנו מודים לאפיפיור ליאו על דברי הנחמה. ישראל חוקרת את האירוע וממשיכה להיות מחויבת להגנה על אזרחים ואתרים קדושים".
מוקדם יותר, הפטריארכיה הלטינית של ירושלים הודיעה כי שלושה בני אדם נהרגו בתקיפת צה"ל וכמה נפצעו, בהם כומר הקהילה שהיה מקורב לאפיפיור לשעבר.
הפטריארכיה גינתה את "הפגיעה באזרחים חפים מפשע ובמקום קדוש. על המלחמה האיומה הזו להסתיים לחלוטין. הקורבנות מצאו מחסה במתחם הכנסייה לאחר שבתיהם, רכושם וכבודם כבר נגזלו מהם".