ראש הממשלה בנימין נתניהו הגיע בצהריים (חמישי) לבית החולים סורוקה בבאר שבע, בליווי שר הבריאות, לאחר שאחד מתוך 25 טילים ששוגרו ישירות מאיראן הבוקר פגע באופן ישיר במתחם המרכז הרפואי. הפגיעה גרמה לנזק לרוב המבנים בבית החולים, ופגעה קשות בשגרת הפעילות של המרכז הרפואי הגדול בדרום. הירי כלל גם פגיעות נוספות בשטח ישראל: טיל אחד נפל ברמת גן, וטיל נוסף פגע בבניין בחולון. בסך הכל נפצו 271 בני אדם, מתוכם 4 במצב קשה.
במהלך ביקורו, התייחס נתניהו לפער בין מטרות התקיפה של ישראל לאלו של טהראן: "אנחנו פוגעים בדיוק במטרות צבאיות - גדרות, כלי נשק. והם? הם פוגעים בבית חולים. בבית חולים עם ילדים, תינוקות, אנשים שלא יכולים לברוח. זה אומר הכול".
נתניהו הדגיש את המחויבות של מדינת ישראל להמשיך במבצע הצבאי הנרחב שמתרחש כעת: "אנחנו עושים כל מה שצריך כדי להגן על עצמנו. חיל האוויר והמודיעין צדים את המשגרים. נפגעו מתקנים קריטיים בתכנית הגרעין של איראן - בנתנז, אספאהן, בצנטריפוגות, ובצמרת המדעית. לא נעצור עד להסרת האיום".
ראש הממשלה התייחס גם לשתיקת חיזבאללה: "זהו אירוע היסטורי. לא רק שאנחנו מסירים איום קיומי, אנחנו משנים את פני המזרח התיכון. עם ישראל מגלה עוצמה בלתי ניתנת להכנעה". בעקבות הנזק שנגרם למתחם הרפואי, משרד הבריאות הודיע על פינוי מסודר של חולים למוסדות רפואיים אחרים, ביניהם שיבא, איכילוב, הדסה, ברזילי, אסותא ושיקום בעדי נגב. המשרד הדגיש כי אמנם מדובר בנזק קל למבנים, אך בשלב זה אין להגיע למלר"ד סורוקה.
דובר צה"ל, תת-אלוף אפי דפרין, התייחס למתקפה ואמר: "המשטר האיראני יורה במכוון לעבר בתי חולים כדי לפגוע במטופלים. נמשיך להכות בלב המשטר האיראני ולא נעצור עד להשמדת האיום".
במהלך התדרוך, נשאל נתניהו גם על ביטול החתונה של בנו אבנר בשל המבצע: "זה המחיר האישי שגם משפחתי משלמת. אך אני גאה בעמידת העם - היא מזכירה את עמידת הבריטים בזמן הבליץ". על סוגיית החטופים אמר: "אני מחויב להחזיר את כולם - חיים ונופלים. גם כעת ננקטים צעדים משמעותיים לשחרורם".