בהנחיית הרמטכ"ל רב-אלוף הרצי הלוי ואחרי חשיפת וואלה, התחקירים של המטה הכללי על אירועי 7 באוקטובר, ינתחו גם את הפערים בין הפקודות שניתנו בפועל ליחידות להיות בכוננות, היקף הכוחות, האישורים שניתנו למפקדים וחיילים לצאת לחופשות, לבין המענה למתקפה של חמאס.
התחקירים על אירועי 7 באוקטובר חושפים שאלות נוקבות אודות ההחלטה של מפקדי היחידות לאשר חופשות מרוכזות לחיילים ולמפקדים לא רק במפקדות אלא גם לבעלי תפקידים מבצעיים. באופן שככל הנראה לא תאם את הכוננות המטכ"לית ופגע ביכולת התגובה של צה"ל למתקפה של חמאס שהחלה ב-06:29.
לפי אתר צה"ל, "הדממה" היא חופש שניתן בזמן מוגדר, ולאורך השנים הוחלט על הדממות בחגים, למשל הדממת חנוכה, הדממת פסח, הדממת חגי תשרי - בסוכות והדממת קיץ. גם היום, באתר צה"ל, מופיע תחת הכותרת: לוח החופשות בצה"ל לשנת 2023, המועדים השונים ביניהם: הושענא רבה - 06/10/2023 ושמיני עצרת ושמחת תורה - 07/10/2023.
גורם צבאי המצוי בפרטים אמר כי "חופשה מרוכזת מתייחסת למפקדות בלבד, ולא אמורה להיות לה השפעה בשום צורה על מסגרות מבצעיות, ובטח לא על הכוננות שלהן. אם יש מסגרות שזה לא עבד ככה, ומפקדים החליטו על דעתם עצמם להוציאו ל'הדממות' ול'חופשות מרוכזות' או כל סוג אחר של חופשות - צריך לדעת שאלו יוזמות פרטיות ולא לגיטימיות".
סוגיית החופשות בין התאריכים 7-6 באוקטובר 2023 נדונה בתחקירים כשהועלתה סוגיית הכוננויות ביחידות - היקף החיילים בכל היחידות בדגש על יחידות בפיקוד דרום, בחיל האוויר ובמפקדות ראשיות. גורמי צבא דחו את הטענות לפיהן ביחידות עשו את המיטב בהתאם לכוננויות ולסדר הכוחות שהוקצו להם לפני החג. עוד הדגיש הגורם הצבאי כי "אין כל נגיעה לפקודות על מסגרות מבצעיות או כוננות מבצעית בכל מה שקשור לניצול ימי חופשה, והיחידות השונות יצטרכו להסביר את מה שקרה בתחקירים המטכ"ליים".
גורם צבאי רשמי ומוסמך: "הגדרת חופשה מרוכזת (הדממה) מתייחסת למפקדות בלבד ואין בה מכדי להשפיע בשום אופן על מסגרות מבצעיות וכוננותן. כלי הטיס עמדו בכוננויות כפי שהוגדרו".
תגובת דובר צה"ל: "נושא הכוננות הינו נדבך כחלק מתחקור אירועי 7 באוקטובר ומה שקדם להם. מטרת התחקירים הינה למידה והפקת לקחים להמשך הלחימה. התחקירים מתבצעים בימים אלו ולכשיסוכמו יוצגו הממצאים בשקיפות לציבור".