בדוח על התמודדות מערכת החינוך עם הקורונה מגלה מבקר המדינה כי שיעור המתחסנים נגד המגפה בבתי הספר היה נמוך. בשנים 2021-2022 התחסנו רק כ-99 אלף תלמידים מכל הגילאים במסגרת בתי הספר, שהם כ-4% מכלל התלמידים (2.3 מיליון) ו-9% מכלל התלמידים המחוסנים (1.1 מיליון). כ-91% מכלל התלמידים המחוסנים עשו זאת בקהילה, ביחד עם הוריהם.
בתחילת ספטמבר 2021 החליטה הממשלה לפתוח את כלל בתי הספר אחרי שנה של לימודים מרחוק בגלל הקורונה. האמצעי המרכזי שנועד לסייע לפתיחה היה מתווה של התחסנות בבתי הספר ושל ביצוע בדיקות אנטיגן מהירות. בפועל, מצא המבקר, רק 429 מתוך יעד של 1,500 בתי ספר השתתפו בחיסונים של בני 5-11 באמצעות ניידות חיסון - 29% מהיעד. רק כמחצית מכלל 2,636 בתי הספר שהיו אמורים לבצע חיסונים בעזרת אחיות שירותי בריאות התלמיד עשו זאת. המבקר אומר שמתווה החיסון בבתי הספר לא השיג את היעד. שיעור ההשתתפות בבדיקות הקורונה היה גם הוא נמוך.
שיעור השתתפות נמוך במיוחד נרשם במתווה "בודקים לומדים", שבמסגרתו היו ההורים אמורים להגיש הצהרות על מצב בריאות ילדיהם לבתי הספר. רק 21% מההורים עמד בדרישה. 79% לא הגישו לבתי הספר את ההצהרות על סמך בדיקות האנטיגן שחולקו לתלמידים. בחברה החרדית נמנעו באחד מימי הבדיקה 98% מהמורים לשלוח דיווח.
המבקר מגלה שמשרד החינוך לא היה ערוך למשימות של טיפול בהתפרצות המגפה על פי התוכנית הלאומית להיערכות לתרחיש פנדמיה. 70% מהמנהלים העריכו שמשרד החינוך הפיץ את ההנחיות לגבי החיסונים והבדיקות בעיתוי שלא אפשר היערכות מוקדמת לביצוען. 56% מהמנהלים ו-53% מההורים היו סבורים שההנחיות לא היו ברורות.
מנהלים וצוותים בבתי ספר נדרשו לארוז ערכות לבדיקות אנטיגן ולחלק אותן לתלמידים, מה שגזל מהם זמן רב. בחלק מהמקרים היו חסרות ערכות לחלוקה לתלמידים. ב-20% מהמקרים חסרו בערכות רכיבים נדרשים לביצוע הבדיקות. תלמידים רבים נותרו ללא ערכות כלל. על פי מחקר של לשכת הפרסום הממשלתית, מחסור זה הגיע לשיעור של 76%.
חוסר היעילות והכשלים בהפעלה של מתווה הבדיקות הובילו לקושי באיתור תלמידים מאומתים, לקטיעה של חקירת שרשראות ההדבקה ולפגיעה בלימודים הרציפים בבתי הספר.
באשר לחיסונים באמצעות ניידות, מנהלים ציינו בסקר שלא הצליחו להגיע לרף הנדרש להזמנת ניידת, שעמד על 50 אישורי הורים לחיסון ילדם באופן זה. המבקר סבור שחל כשל בפעולות שנקט משרד החינוך כדי לשכנע את ההורים לאשר את השתתפות ילדיהם במתווה חיסון זה, למשל באמצעות הרשתות החברתיות. לדעת המבקר, שימוש בכלים מתאימים להסברה היה מוביל להגדלת היקף ההשתתפות בחיסון בבתי הספר. סקר שנערך העלה שכ-40% מההורים נמנעו מחיסון ילדיהם בבתי הספר מסיבות הנובעות ישירות או בעקיפין מהסברה בלתי יעילה.
המבקר המליץ למשרד החינוך להפיק לקחים מהכשלים ביישום מתווה הבדיקות והחיסונים, לפעול לתיקון הליקויים ולבחון את יישום ההמלצות לצורך הגברת האפקטיביות של אמצעים אלה במקרה של התפרצות נוספת של קורונה, או פנדמיה אחרת.