חמישה בני אדם הנאשמים במעורבות בפיגועי 11 בספטמבר, בהם מי שנחשב למוח שמאחוריהם, יעמדו לדין בינואר 2021. חאלד שייח מוחמד, ארכיטקט מתקפת הטרור הקטלנית ביותר בהיסטוריה של ארצות הברית, נאשם יחד עם שאר חברי הקבוצה בפשעי מלחמה וברצח של כמעט 3,000 בני אדם.
משפטם יהיה הראשון של מעורב כלשהי בפיגועים, והוא יתקיים כמעט 20 שנה אחרי המתקפות שהתרחשו בניו יורק, בוושינגטון ובפנסילבניה. אם הם יורשעו בבית משפט במתקן המעצר בגואנטנמו, עשוי להיגזר עליהם עונש מוות.
חאלד שייח מוחמד נתפס בפקיסטן ב-2003, והוא הועבר למתקן הכליאה בקובה. עם זאת, ניסיונות קודמים להעמיד לדין את הקבוצה נתקלו בעיכובים.
כשהוא הועמד בפני בית משפט צבאי ב-2008, אמר בכיר אל-קאעדה כי הוא מתכוון להודות באשמה וכי הוא ישמח להפוך לשהיד. ב-2009, ממשל אובמה, שהבטיח לסגור את גואנטנמו, ניסה להעביר את המשפט לניו יורק אבל ביטל את ההחלטה ב-2011 בשל התנגדות הקונגרס. בסופו של דבר, החמישה הואשמו רשמית ביוני אותה שנה בעבירות הדומות לאלו שבהן הואשמו תחת ממשלו של ג'ורג' וו בוש.
לפי הפנטגון, חאלד שייח מוחמד הודה כי הוא היה אחראי מ"א' ועד ת'" לפיגועי 11 בספטמבר. התביעה בארצות הברית האשימה אותו במעורבות בשורת פעולות טרור אחרות, כולל הפיגועים במועדון באי באלי, ב-2002, הפיגוע הראשון במגדלי התאומים, ב-1993, רצח העיתונאי היהודי אמריקני דניאל פרל והניסיון לפוצץ מטוס באמצעות נעלי נפץ.