שר הביטחון, שאול מופז, הופיע בוועדה לחקר אירועי עמונה, ותקף את האלימות שהופגנה כלפי כוחות הביטחון במהלך פינוי המאחז.
מופז אמר לוועדה, כי "האלימות שהופגנה כלפי כוחות הביטחון היא בלתי נסבלת ובלתי מקובלת", וציין כי הכוחות נתקלו ב"שנאה בלתי רגילה", אף שרצו להגיע להבנה על פינוי בהסכמה.
מופז קרא לבדוק את כל הפרות החוק ברקע לאירועי עמונה, וציין כי "תחילתו של האירוע הזה היא בהפרת חוק ברורה לחלוטין". מופז המשיך ואמר: "אי אפשר לקבל מצב של 'איש הישר בעיני יעשה'.
מופז אמר עוד, כי הוא מופיע בשם הקצינים והחיילים שהיו מעורבים בהריסת המבנים, ונימק: "כשר ביטחון, צריך להוציא את צה"ל מכל ויכוח פוליטי, במיוחד בעת הזו, ערב בחירות". השר הוסיף, כי צה"ל יודע לתחקר את עצמו היטב, וציין כי "ראוי היה לתת לצה"ל להשלים את תחקיריו".
בתחילת עדותו הקצרה בפני הוועדה, הדף מופז טענות על שימוש יתר בכוח מצד כוחות הביטחון. "כל מי ששלח את ילדיו לשם חייב קודם כל דין לעצמו ואחר כך למדינה. לא שולחים אנשים להגן על מעשים בלתי חוקים בדרך של אלימות".
השר עזרא: המשטרה הפכה שק חבטות
לפני השר מופז, הופיע בפני הוועדה השר לביטחון פנים, גדעון עזרא, ומתח ביקורת חריפה על פעילותה. השר חזר ואמר, כי המשטרה מילאה את תפקידה כדין, וטען כי "מי שממלא את תפקידו כדין אינו צריך להיות המטרה הראשונה". לדבריו, "חברי כנסת, כאלה ואחרים, גורמים לכך, שהכוחות שלנו, באירוע עתידי, יחשבו פעמיים אם למלא את התפקיד".
השר מחה על כך, ש"המשטרה הפכה לשק חבטות במדינה הזאת על ידי מדליפים מהשמאל של מזרחי ושותפיו, שחבל שנמצא עדיין במשטרה". הדברים כוונו לניצב משה מזרחי, ראש אגף החקירות לשעבר במשטרה, שמכהן היום כאחראי על המשמר האזרחי.
השר הוסיף: "אין כאן כוונה להגיע לחקר האמת. אתם מוצאים לנכון להזמין דרגים משטרתיים שמאויימים גם ככה, ואתם בדרך שלכם מאיימים עליהם גם הלאה".
השר הסביר לוועדה, מדוע הורה לקציני המשטרה שלא להגיע לוועדה. לדבריו, השוטרים, שהיו מעורבים בפינוי המאחז, אינם זוכים להגנה, ומאויימים בידי גורמים שונים. זאת, בניגוד אליו, ולמפכ"ל המשטרה, אשר זוכים לאבטחה צמודה, ויעידו בפני הוועדה.
ח"כ אילן שלגי (הסיעה החילונית) תקף בחריפות את דבריו של עזרא, ואמר: "אני המום מהנימוק לאי הגעתם של הקצינים הבכירים. האם ייתכן, שהדמוקרטיה הישראלית לא תפעל והחוק לא יתבצע?... תדאגו לכך שהם יהיו מאובטחים, בלי קשר לוועדה הזו. חלק מהעבודה שלכם זה לבוא לוועדה הזו".
חבר הוועדה ח"כ אורי אריאל שאל: "האם ניתנה הוראה להשתמש באלות ומי נתן את ההוראה?" ועזרא השיב כי למשטרה מדרג של אמצעי תגובה לפי חומרת ההפגנה. "ברמה ג' של הפרות סדר קשות, מותר להשתמש ברימוני הלם וגז ובאלות".
שטייניץ שאל "האם נשקלה, לאור רמת ההתנגדות העזה, אפשרות של שימוש בגז מדמיע מחוץ לבתים, והאם בדיעבד שימוש בהם יכול היה להוריד את רמת השימוש באלות". עזרא השיב: "הנושא בהחלט נשקל, אבל גז מדמיע יכול להזיק מאוד לאנשים עם בעיות נשימה".
עזרא הבהיר, כי הסמכות באלו אמצעים להשתמש לפיזור הפגנות בשטחים היא של הריבון - אלוף פיקוד המרכז.
השר נשאל, האם ניתנו הוראות שונות בפינוי הרצועה ובפינוי עמונה, והשיב בשלילה. לדבריו, "יישמנו את כל מה שלמדנו מוועדת אור ומוועדות אחרות".
בהתייחסו לפציעתם של שני הח"כים בפינוי (אפי איתם ואריה אלדד), אמר עזרא: "אני מקווה שחברי הכנסת הבריאו מהפציעה. יש שוטרים שעוד לא הבריאו. יש שוטר שיושב חצי שנה בבית עם בלוק ברגל, ומי שרוצה לבקר אותו, מוזמן".
בסוף הדיון דיבר ח"כ עוזי לנדאו (ליכוד), שאמר לשר לביטחון פנים: "אני מוטרד מזה שאתה צריך להיזכר מה קרה. זה לא היה לפני כל כך הרבה חודשים".