סגן שר הביטחון, אפרים סנה, אמר כי הפיגוע בצומת מי עמי שאירע לפני כשעה, הוא חלק מתופעה "שבה הפעילות החבלנית זוחלת עכשיו לכיוון הקו הירוק", והוסיף כי "אתמול היה פיגוע באזור קיבוץ אייל, צפונה לקלקיליה".
לדברי סנה, כוחות הביטחון יתמודדו עם התופעה "גם בהגברה נוספת של הפעילות הבלתי שגרתית וגם בהאצה של תוכנית מיכשול. אנחנו נבנה יותר אמצעי מיכשול שיקשו על התנועה של רכבים לא רצויים מן הגדה לשטחנו".
השר בנימין בן אליעזר אמר בתגובה לפיגוע, כי "האירוע מחזק את דעתי שבמקום להעניש אוכלוסיות שלמות בהענשה כללית ובעונשים קונבנציונלים, אופן הטיפול בסיפור הזה צריך להיות נגד מבצעי הפיגועים ושולחיהם. שני הצדדים צריכים לדעת מהם כללי המשחק, ישראל לא יכולה להגיב על מצבים כאלה, והיא תגיב במדיניות קבועה עקבית ומתמשכת".
בנוגע לאפשרות כי הוא יתמנה לתפקיד שר הביטחון, אמר בן אליעזר כי "אני סומך על צה"ל ועל מפקדיו, ואם אני אשב מולם הם ימצאו פרטנר בעל ניסיון רב בשטחים, ונפעל יחד להביא למציאות של רגיעה עד כמה שניתן. בד בבד עם המלחמה בטרור, נצטרך לחתור להידברות".
ח"כ גדעון עזרא: "הפיגוע מעיד על חוסר התועלת שבסגר"
חבר הכנסת רחבעם זאבי (גנדי) מסיעת האיחוד הלאומי - ישראל ביתנו, אמר בתגובה לפיגוע לגלי צה"ל כי הוא מציע לראש הממשלה הנבחר, אריאל שרון, "להבין שהפיגועים האלה מקורם בשטחי הרשות הפלסטינית. היא איננה לוחמת בטרור, נהפוך הוא. הם שיחררו את המהנדס מוחמד דף, ואנשי חמאס אחרים, והם מעודדים אותם לפעילות".
גנדי הוסיף כי אין "לבנות על כך שהרשות הפלסטינית תעשה את העבודה. צריך לעשות אותה לבד. גם אם זה מחייב להיכנס לשטחי A, ולכל מקום שלא חשוב מה ההגדרה שלו באותיות האי בי סי, כדי לתפוס את העקרבים ולרוצץ את גולגולתם. אל לנו להסס, שנפר הסכם, כי אין הסכם".
בנוגע לדבריו של השר בן אליעזר, שאמר כי במקביל ללחימה בטרור יש להמשיך בהידברות עם הפלסטינים, אמר גנדי: "כמה נדבר איתם? עד היהודי האחרון? אוסלו מת, ערפאת אינו פרטנר לשלום, ואם נמשיך לדבר אז יהיה לנו שר ביטחון של דיבורים".
ח"כ גדעון עזרא מהליכוד אמר בתגובה לפיגוע: "זה מוכיח שגם בימי סגר יש כניסה של כל מי שרוצה להיכנס, ולעשות כאוות נפשו בשטח ישראל, כך שהפיגוע הזה מעיד על חוסר התועלת שבסגר".
"צריך לדעת שהמטענים מגיעים ממרכזי הרשות הפלסטינית, ואם הרשות הפלסטינית לא תילחם בהם ותמנע את כניסתם אנחנו נצטרך לעשות את זה", דברי עזרא.
ח"כ מאיר שטרית מהליכוד אמר כי, "הממשלה החדשה תצטרך להתמודד עם המצב הזה בצורה הרבה יותר נחרצת. הפיגוע הזה מהווה החמרה נוספת. שמירה על ביטחון אזרחי מדינת ישראל צריכה להיות המטרה מספר אחת. אני לא מכיר שום ממשלה מערבית שהייתה מסכימה לסבול מצב שמישהו רוצח ויורה ופוגע באזרחים שלה. יש הרבה מקומות שאפשר לפגוע בהם ולהעניש".