האירועים האלימים בכפר הפלסטיני קוסרה שבשומרון הציפו מחדש את האתגר של לוחמי צה"ל בטיפול באוכלוסייה אזרחית בכלל ובפשיעה לאומנית בפרט. בעקבות גל של פשיעה לאומנית וחיכוך אלים בין אזרחים ישראלים לאזרחים פלסטינים, הוחלט לתגבר את הזירה בגדוד 51 מחטיבת גולני, שרק סיים תעסוקה מבצעית בלבנון. הכוחות מיהרו לתפוס את המרחב ולבודד אותו במטרה למנוע כניסה של פורעי חוק ישראלים. אולם בפועל, הלוחמים יצרו חיכוך בעצמם כאשר החליטו לפנות אוכלוסייה פלסטינית ולהשתלט על בתיהם כדי לתצפת ולפעול מתוכם - פעילות שגרמה להד תקשורתי נוסף בזירה הבינלאומית.
גורם ביטחוני התייחס להתנהלות בשטח ואמר: "במקום לפתור את הבעיה שנוצרה בשטח ולהרגיע את האזור הם יצרו מהומה בעצמם. לא מתוך כוונה רעה אלא רק מתוך העובדה שזה מה שהם מכירים. לזה אימנו אותם. לא העבירו אותם הכשרה מנטלית מתאימה וברגע שמכניסים גדוד שהתאמן ונלחם במחבלים בעזה ובלבנון, וביצע מעצרים ברחבי יו"ש, הוא לא באמת יודע להתמודד עם אוכלוסייה. בטח לא אוכלוסייה ישראלית ועל אחת כמה וכמה פשיעה לאומנית. זה עניין של אכיפת חוק וסדר ולא לחימה".
גם בקרב הלוחמים נשמעה ביקורת חריפה על הפיקוד הבכיר, והם טענו כי המשימה לא הייתה ראויה מבחינתם. אחד המפקדים ציין כי "לא היו צריכים להקפיץ אותנו למשימה ללא הכשרה מוקדמת. המעבר היה חד מדי. נדרשת הכנה משמעותית מאוד במעבר בין לחימה לטיפול באוכלוסייה".
הוא הוסיף כי בשלב הראשון שונתה המשימה והוקפצו למקום לוחמי מג"ב. בהמשך אמורים להגיע לגזרה לוחמי סיירת חרוב על מנת להחליף את לוחמי גולני. עם זאת, מבדיקת וואלה עולה כי לוחמי גדוד 51 עדיין נמצאים בשטח וטרם הוחלפו.
ברקע הדברים, גורמי הביטחון מתריעים כי האירועים האלימים הבאים בין האוכלוסייה הפלסטינית לישראלית הם מעבר לפינה, וכי אוגדת יו"ש חייבת לקבל יותר משאבים וכוח אדם כדי להתמודד עם אירועים מתפרצים.
כחלק מהפקת הלקחים, הוחלט בצה"ל כי אגף המודיעין (אמ"ן) יגביר את המעורבות שלו בזירה הפלסטינית ביו"ש, לצד תגבור נקודתי של האזורים הנפיצים באמצעות כוחות מג"ב.
מפקד מחוז שי אומר: "מאז פרסום דבריו של כ"ץ, הגידול באוכלוסייה הישראלית בשטחי C ביהודה ושומרון בישובים הישראלים וצורת ההתיישבות החדשה, החוות החקלאיות שהתפתחו מחוץ לישובים מחייבים ביצוע התאמות נדרשות והעברת הטיפול וסמכויות האכיפה בנושאים האזרחיים לידי משטרת ישראל תוך הקצאת המשאבים, הסד"כ המתאים, פריסת כוחות והאצלת הסמכויות הנדרשות למשטרה לצורך ביצוע המשימות.
"לצד זאת יש למסד לצמיתות את השותפות הבין ארגונית "המפקדה המשמתית" לטיפול ומנעת אירועי אלימות קיצוניים ביו"ש המשותפת לשבכ למשטרה ולפיקוד המרכז כפי שהנחה ראש הממשלה והוכיחה את עצמה באותם מקומות ואזורים שפעלה מיום הקמתה במהלך החודשים האחרונים להתמודדות עם הפורעים והאלימים הקיצונים. אלה צעדים משמעותיים נדרשים לסיכול הטרור והפח"ע , להגברת המשילות ,טיוב השירות לאזרחים וחיזוק שלטון החוק בשטחי יהודה ושומרון ופינוי צה"ל לביצוע משימותיו העיקריות".