יממה לאחר הרצח שטלטל את בני ברק, הובא הבוקר (חמישי) גיא אכטלינגר, החשוד ברצח הרב ישי פור, לבית משפט השלום בתל אביב. המשטרה ביקשה להאריך את מעצרו ב-12 ימים בטענה למסוכנות גבוהה, חשש לשיבוש חקירה והצורך בביצוע פעולות חקירה נוספות, אולם בית המשפט קיבל את הבקשה באופן חלקי והאריך את מעצרו בשבעה ימים, עד 27 במאי.
במהלך הדיון חשף נציג המשטרה את גרסת החוקרים לאירוע הקשה שהתרחש אתמול בתוך כולל : "חזון איש" ברחוב האר"י בבני ברק. לפי החשד, אכטלינגר הגיע למקום בשעות הצהריים, ניגש לעבר פור בזמן שישב לצד בנו בן ה-13 במהלך תפילה ולימוד תורה, ודקר אותו מספר פעמים. האב התמוטט לעיני בנו היחיד בתוך בית המדרש, בעוד המתפללים במקום מנסים להבין בתוך שניות מה בדיוק התרחש סביבם.
צוותי מד"א שהוזעקו לזירה פינו את פור לבית החולים שיבא בתל השומר כשהוא במצב אנוש וסובל מפציעות חודרות, אך זמן קצר לאחר מכן נאלצו הרופאים לקבוע את מותו.
אברכים הלומדים בכולל סיפרו כי בימים שקדמו לרצח התנהלו בין החשוד לבין פור עימותים חוזרים סביב לימוד כתבי הרמב"ם. לדבריהם, החשוד אכטלינגר, שמוכר באזור, נהג להתעמת עם המנוח ולטעון כי חל איסור ללמוד בספרי הרמב"ם. לטענת האברכים, רק ערב קודם לרצח פנה החשוד לפור באופן מאיים ואמר לו כי אם ימשיך ללמוד בכתבי הרמב"ם "הוא לא ישלים את שנתו". פחות מיממה לאחר מכן, כך לפי החשד, הגיע לכולל ודקר אותו למוות.
במשטרה טענו כי מיד לאחר הדקירה נמלט אכטלינגר מהכולל במטרה לברוח, להעלים ראיות ולשבש את החקירה. בתיעוד ממצלמות האבטחה שנאסף בידי החוקרים נראה החשוד יורד במהירות במדרגות המתחם ונמלט מהמקום דקות לאחר הרצח. במשך שעות ארוכות ניהלו כוחות גדולים של מרחב דן מצוד אחריו, עד שסמוך לשעה 20:00 אותר בבית שמש ונעצר על ידי שוטרי תחנת בני ברק-רמת גן בשיתוף שוטרי תחנת בית שמש.
לפי המשטרה, בין החשוד לבין המנוח הייתה היכרות מוקדמת, והרקע לאירוע הוא סכסוך שהתנהל בין השניים. במשטרה ציינו כי לא התקבלו בעבר תלונות מצד פור נגד החשוד.
עוד עלה בדיון כי מאז מעצרו בחר אכטלינגר לשמור על זכות השתיקה במהלך חקירתו. למרות זאת, במשטרה טענו כי בידי החוקרים כבר נמצאו ממצאים ראייתיים הקושרים אותו לחשדות המיוחסים לו. במקביל, החוקרים ממשיכים לגבות עדויות נוספות מאנשים שנכחו בכולל בזמן הרצח.
סנגורו של החשוד, עו"ד גיל פרידמן מהסנגוריה הציבורית, טען בדיון כי אכטלינגר הוא אדם בעל רקע נפשי וביקש לשלוח אותו לבדיקה פסיכיאטרית. במשטרה השיבו כי החשוד עצמו לא העלה כל טענה הנוגעת למצבו הנפשי במהלך החקירה.
לקראת סיום הדיון פנה השופט אל החשוד ושאל אם ברצונו לומר דבר מה. אכטלינגר הביט לעברו והניד את ראשו בשלילה. הלילה התקיימה הלווייתו של פור בבני ברק, אליה הגיעו מאות בני אדם, בני משפחה, מכרים ותושבי העיר שהתקשו לעכל את הרצח שהתרחש בלב בית המדרש. ברגעים הכואבים ביותר של מסע הלוויה, בנו היחיד בן ה-13, שהיה עד לרצח אביו בתוך הכולל, עמד לצד הקבר וקרא קדיש.
בבני ברק ניסו היום לחזור לשגרה, אבל ברחוב האר"י ובסביבת כולל "חזון איש" נותר בעיקר ההלם. המתפללים שחזרו למקום שבו התרחש הרצח מספרים על הדקות שבהן בית מדרש הפך לזירת דמים, ועל הילד בן ה-13 שראה את אביו נדקר מול עיניו, רגע אחד שלא יימחק מהעיר עוד זמן רב. במקביל, במהלך שבעת ימי המעצר הקרובים ינסו חוקרי המשטרה לגבות לראשונה את גרסתו של החשוד, לצד קבלת ממצאי הבדיקה הפסיכיאטרית שאליה נשלח בעקבות החלטת בית המשפט.