העימות בין קיש לבהרב-מיארה סביב העתירות בנושא החינוך החרדי מגיע גם לבג"ץ: לאחר ששר החינוך יואב קיש סירב לאפשר לגורמי המקצוע במשרדו להשתתף בפגישה עם היועמ"שית, גלי בהרב-מיארה, זו עדכנה את בית המשפט כי הדבר מונע ממנה לגבש את עמדת המדינה בתיק.
במכתב שהגישה לבג"ץ כתבה היועמ"שית כי בעקבות החלטת בית המשפט נקבעה ישיבה ל-24 במאי בהשתתפות גורמי המקצוע והייעוץ המשפטי ממשרדי החינוך והאוצר, לצורך גיבוש הודעת עדכון בתיק. עוד ציינה כי ישיבת הכנה בנושא כבר נערכה אצל המשנה ליועמ"שית אביטל סומפולינסקי.
לדבריה, יום לאחר מכן הודיע קיש כי אינו מאפשר לבכירי משרדו - בהם מנכ"ל המשרד, מנהל המחוז החרדי ובכירים נוספים - להשתתף בפגישה עם היועמ"שית עצמה. "בנסיבות אלה, נמנעת מהיועצת המשפטית לממשלה האפשרות לגבש את הודעת העדכון בהתבסס על מכלול ההיבטים הרלוונטיים", נכתב.
בתגובה שהגיש לבג"ץ, תקף קיש את בהרב-מיארה וטען כי היא עצמה סירבה להגיע לפגישה שנקבעה עמו ב-5 במאי אצל מזכיר הממשלה יוסי פוקס, שנועדה לדון במחלוקות סביב העתירות ובסוגיית הייצוג הנפרד. "לא ייתכן שבנסיבות האמורות, בהן היועצת סירבה להיפגש עימי ולדון בסוגיות האמורות, היא תזמן בחלוף כשבועיים בלבד גורמי מקצוע ממשרדי על מנת לדון באותם נושאים בדיוק", כתב קיש.
השר הדגיש כי גורמי המקצוע במשרד החינוך כבר השתתפו השבוע בדיון אצל המשנה ליועמ"שית, השיבו לכל השאלות המקצועיות וימשיכו לעשות זאת גם בהמשך - בכתב או בפגישות נוספות עם גורמי המקצוע במשרד המשפטים. לדבריו, אין מניעה שהייעוץ המשפטי של משרדו ישתתף בפגישה עם היועמ"שית, אך אין צורך בנוכחותם של אנשי המקצוע עצמם.
עוד טען קיש כי פגישות ישירות בין גורמי מקצוע במשרד ממשלתי לבין היועצת המשפטית לממשלה אינן דבר שבשגרה, במיוחד ללא תיאום מול השר הממונה. "זימון גורמי המקצוע לפגישה ללא תיאום עימי, כאשר במקביל היועצת מסרבת להיפגש לבקשת מזכיר הממשלה וכן מסרבת לאפשר לי ייצוג נפרד - מעלה חשש כבד בדבר המניעים שמאחורי הפגישה", כתב.
בסיום תגובתו טען קיש כי גם לאחר הדיון שנערך השבוע אצל המשנה ליועמ"שית, נותרו פערים מהותיים בין עמדת משרדו לבין עמדת הייעוץ המשפטי לממשלה, וכי "אין כל היתכנות להגיע למתווה שהתבקש על ידי בית המשפט", מבלי להכריע בסוגיות המצויות בלב העתירות.