בעקבות הצורך לאפשר חזרתם של ישראלים לארץ ולאור הניסיון והידע שצברה מפקדת אלון בפעילותה בעת מבצע "עם כלביא" מוצע להטיל על מפקדת אלון לסייע למשרד התחבורה במשימה הלאומית להשיב את הישראלים המצויים בחו"ל לישראל. כך הוחלט בין שר הביטחון ישראל כ"ץ לשרת התחבורה מירי רגב.
שר הביטחון הנחה את צה"ל להקים את המפקדה. הפעילות שתבוצע במסגרת זו כוללת הפעלת מוקד טלפוני ואנושי לטיפול בעשרות אלפי פניות אזרחים, ניתוח מידע המתקבל מכלל הגורמים הרלוונטיים והפקת תובנות מבצעיות בזמן אמת, ריכוז מקרים חריגים ובקשות לסיוע הומניטרי, וביצוע מיון ראשוני ובדיקה של עמידה בקריטריונים שנקבעו על ידי הוועדה בראשות מנכ"ל משרד התחבורה והעברת המלצות בהתאם לחברות התעופה.
הפעלת מפקדת אלון תלווה בהקמת חדר מצב לאומי, אשר ירכז את כלל הנתונים והתמונות מהשטח, ויגבש תמונת מצב עדכנית ורב-מערכתית. לצורך הפעלת המוקד ישולבו כ-30-40 חיילים סדירים בכל משמרת, אשר יוכשרו למתן מענה מהיר, מדויק ורגיש לכל פונה. מערכות המידע יתמכו בניהול כולל של כלל הפניות והנתונים, תוך טיוב והצלבת מידע חיוני לקבלת החלטות בזמן אמת, ובמציאות משתנה. למשרד החוץ יהיה נציג קבוע במשל"ט.
חזרת הישראליים תתבסס בעיקרה על חברות תעופה וספנות אזרחיות, והממשלה לא תשתתף בעלויות כרטיסי טיסה או הפלגה. כמו כן, מוצע ליצור מנגנון שיאפשר בחינה שוויונית ושקופה של מקרים הומניטריים וחריגים, אשר מתן העדיפות להם מבוססת על שיתוף הפעולה הוולונטרי של חברות התעופה.
במקביל להפעלת המנגנון הוולנטרי המוצע יבחן משרד התחבורה בשיתוף יתר משרדי הממשלה הרלוונטיים, את הצורך בקידום הסדרים נוספים לרבות במידת הצורך תקנות לשעת חירום שיאפשרו מתן הנחיות מחייבות בהיבטים שונים הנדרשים לטובת קיום המבצע.