גורמים במערכת הביטחון אמרו הערב (שישי) כי המחיר הכבד שגבו הפיגועים בבית שאן, יגרמו לנקיטת יד קשה של מערכת הביטחון כלפי יהודה ושומרון. "תגבור הכוחות ועיבוי קו התפר מצביע על כך שזה לא יעבור בשקט. כוחות צה"ל כבר פועלים בקבטיה ומוקדים נוספים בחטיבה המרחבית מנשה".
הפיגועים היום מעלים שוב את השאלה על המדיניות הממשלתית בנוגע לצמצום דרמטי של כניסת פועלים פלסטינים מאיו"ש לישראל מאז ה-7 באוקטובר, הלחץ הכלכלי הכבד המופעל על הרשות הפלסטינית ברקע עליית האבטלה, ואוזלת יד של המערכת הביטחון משני עברי קו התפר: צה"ל, שב"כ, מג"ב ומשטרת ישראל בכל מה שקשור למעצר שב"חים וטיפול בתופעה המתגברת בעיקר סביב ירושלים.
בפועל, הדרג המדיני, החליט על צמצום דרסטי של מכסת הפועלים הפלסטינים לישראל, ייבוא פועלים זרים מחו"ל, מבלי להתמודד עם ההשלכות באיו"ש ומדיניות עתידית. "נוצר מצב שמעלים עין מהתסיסה בשטחי יו"ש וכדי לא להלהיט עוד יותר את הרוחות ממצמצים עיניים בכל מה שקשור להסתננות השב"חים לישראל. מזכיר את הימים שקדמו ל-7 באוקטובר.", אמר גורם ביטחוני המצוי בפרטים.
כאמור, גורמים בצה"ל הדגישו כי המחבל שביצע את הפיגועים היום היה מנוע כניסה בהחלטת שב"כ ולכן הסתנן לישראל בניגוד לחוק, "צריך לקבל החלטה ברורה. או שמטפלים בתופעת השב"חים ביד קשה או שמאפשרים להם להיכנס ולעבוד בישראל. מצב הביניים הזה מסוכן מאוד וזה עוד לפני העיסוק לעומק בכלכלה הישראלית ואיזה ענפים נפגעו מההחלטה של הממשלה".
בתוך כך, במערכת הביטחונית הצביעו על מספר מבצעים שביצעו בפיקוד המרכז ביניהם "חמש אבנים" שלא הניבו את התוצאות שקיוו להן בגלל פערים בתחום המודיעין בעיקר בדגש על השומרון. אחד הגורמים, אמר כי ציפו ליותר עצורים וחשיפה של יותר אמצעי לחימה.
כעת החשש בצה"ל כי הפיגוע המשולב ישמש השראה למחבלים בודדים נוספים שיבצעו פיגועי חקיינות נוספים באמצעות דריסות ודקירות או נשק חם בשטחי יו"ש ובעומק מדינת ישראל תוך ניצול הפרצות בקו התפר