שר הביטחון ישראל כ"ץ כתב הערב (שבת) כי הופתע כשהרמטכ"ל אייל זמיר לא נענה לפנייתו וקיים את דיון השיבוצים לקצינים הבכירים על אף המלצות הוועדה שמינה. "מאחר ואני הגורם שמאשר על פי חוק את מינויי הקצינים הבכירים בצה"ל מדרגת אל"מ ומעלה, הטלתי על מבקר מערכת הביטחון, שהוא הגורם המקצועי המוסמך ביותר, להשלים את התחקירים ולהביא בפניי את הממצאים שיאפשרו לי לשקול את עמדתי בנושא מינויי הבכירים, וביקשתי מהרמטכ"ל להמתין 30 יום עם נושא השיבוצים כדי שיהיה בידיי המידע הנדרש ושנוכל לפעול בהתאם לנוהל שגיבשנו - הכולל התייעצויות מוקדמות", הבהיר כ"ץ.
עוד הוסיף שר הביטחון כי הופתע גם מעצם זימון הקצינים והסנקציות אותן הטיל זמיר, זאת מבלי לעדכן אותו ומבלי להיוועץ בו.
בשבוע שעבר פורסם בוואלה כי שר הביטחון כ"ץ הודיע על מינוי מבקר מערכת הביטחון לתחקר את מסמך חומת יריחו (תוכנית הפשיטה של חמאס) ובהתאם מתי התקבלה לראשונה בצה"ל ומי ידע עליה. ימים בודדים לאחר מכן עדכן הרמטכ"ל כי מינה את האלוף במיל' רוני נומה לתחקר את סוגיית חומת יריחו. הודעת שר הביטחון הערב נועדה לצאת כנגד החלטת הרמטכ"ל לגבי צוות התחקיר של נומה והחלטות נוספות.
בהודעה חריגה, הרמטכ"ל זמיר כתב באיגרת למשרתי צה"ל אמש כי יש להקים ועדת חקירה חיצונית ואובייקטיבית שתבחן את מחדל שבעה באוקטובר ברמה הלאומית, בדומה לוועדת החקירה שהוקמה לאחר מלחמת יום הכיפורים. במכתב ששלח לקצינים בצה"ל, המתבסס על מסקנות צוות תורג'מן שבחן את תחקירי המלחמה, כתב זמיר כי "צה"ל לקח אחריות ותחקר עצמו, אולם האירוע אינו נחלתו בלבד ולא יהיה זה ראוי להפנות את כל הזרקורים רק כלפיו", והדגיש כי ועדה כזו נדרשת כדי "להגיע לחקר האמת ולמסקנות מלאות".
לדבריו, ועדת חקירה כזו צריכה לתחקר "את הממשק בין הדרג המדיני לדרג הצבאי, את התפיסות המדיניות והביטחוניות שקדמו למלחמה, את 'הקונספציה', את המודיעין ואת ההתרעות שהונחו בפני מקבלי ההחלטות, את תהליכי הבקרה והמעקב ואת יחסי הגומלין והאחריות בין הגורמים השונים".
זמיר התייחס במכתבו גם להטלת אחריות אישית על מפקדים, על רקע המחלוקת סביב מסקנות צוות תורג'מן והדיון הציבורי על בדיקתן מחדש. "הוועדה לא דנה באחריות אישית, מחדל שבעה באוקטובר הוא כשל מערכתי ומתמשך", כתב. "הטלת אחריות אישית על מפקדים, שהקדישו את חייהם לביטחון המדינה, היא החלטה כבדה, וראוי שהחלטות כאלה לא יהיו מושפעות מלחצים חיצוניים וייעשו בזהירות יתרה". זמיר הוסיף כי "אין ספק שכל אחד מבעלי התפקידים ששמם נקשר באירועים - יישא על עצמו עול כבד בכל ימי חייו. רק ועדת חקירה בעלת תמונה מלאה, רחבה ומעמיקה, תוכל לקבל הכרעות אישיות נוספות שוויוניות וראויות. עם זאת, אין בכך כדי להפחית מאחריותו של צה"ל ושל המפקדים".