מערכת היחסים בין שר הביטחון ישראל כ"ץ לרמטכ"ל רב-אלוף הרצי הלוי נמצאים על סף פיצוץ, ועולה השאלה האם כ"ץ יראה לו את הדלת החוצה או שישלוט בשיבוצים בצה"ל בכפוף להתקדמות התחקירים המטכ"ליים עד שהרמטכ"ל ישתכנע.
הרמטכ"ל רוצה לקדם עשרות מינויים בצמרת צה"ל, מדרגות אלוף משנה ועד אלופים במטכ"ל, אולם שר הביטחון מתנגד לכך והציב תנאי - כל עוד התחקירים המטכ"ליים לא הסתיימו - לא יוכל לאשר את השיבוצים.
לפי מקורות בצמרת צה"ל, הרמטכ"ל לא יסיים את התחקירים עד סוף חודש ינואר ולא את אירועי הלילה ב-7 באוקטובר, במהלכם הרמטכ"ל שוחח עם מפקד פיקוד הדרום, האלוף ירון פינקלמן, וראש אגף המבצעים, האלוף עודד בסיוק, שהצטרף מאוחר יותר לשיחה.
לכן, השאלה הגדולה ביותר היא מה יקרה אם הרמטכ"ל לא יעמוד בהנחיית השר לסיים את התחקירים כפי שנקבע בין הצדדים. האם שר הביטחון יאריך את המועד לסיום התחקירים או שיקבל החלטות אחרות נגד הרמטכ"ל. עיקר הוויכוח הוא על מינוי אלופים במטכ"ל.
חשוב לציין, הרמטכ"ל מתעקש שקצב ההתקדמות של התחקירים נעשה בהתאם לעומס בפעילות המבצעית בזירות השונות. בסביבת השר טוענים כי אין מעבר לדרישה להגיש תחקירים - אין כוונה נוספת.
בתוך כך, לוואלה נודע כי מבקר המדינה, מתניהו אנגלמן, פנה לשר הביטחון על מנת לקיים פגישה בנושא התחקירים, מאחר שהוא לא זוכה לשיתוף פעולה כמצופה ובכפוף לחוק חרף הפניות לרמטכ"ל.