קצינים בכירים בצמרת צה"ל ומשפחות שכולות מפנים אצבע מאשימה כלפי הרמטכ"ל הרצי הלוי ומתלוננים על גרירת רגליים בביצוע התחקירים המטכ"ליים על התהליכים שקדמו ל-7 באוקטובר, והתנהלות הצבא באותו הבוקר. חלקם, בהם גם משפחות התצפיתניות שנפלו, שלחו כתב מכתבים נוקבים מאוד לרמטכ"ל בדרישה לפרסם את עובדות האמת באופן מיידי.
בצה"ל, מנגד, מתגוננים וטוענים כי מדובר בתהליך עמוק ויסודי. לפי נתוני הצבא, יש
ארבעה מוקדים בחקירת ההתנהלות: התפיסה שקדמה ל-7 באוקטובר, התנהלות אמ"ן עד שעות הלילה (6 באוקטובר), ההתנהלות במהלך הלילה והפעילות הצבאית החל מתחילת המתקפה, החל מהשעה 06:29 ועד שלושה ימים לאחר מכן - בה אירעה התקרית האחרונה בנגב המערבי.
לוואלה נודע כי ארבעת מוקדי התחקיר הללו מחולקים ל-18 תתי-מוקד. כל תת-מוקד נחלק לעוד הסתעפויות, ובכל אחד ממנו יש מספר גורמים שנדרשים לספק עובדות לתחקיר: גורם מהזרוע הצבאית הנחקרת וגורם מטכ"לי שבוחן את הטענות ומביט על התנהלות עד למטכ"ל כולל הרמטכ"ל.
עוד החליט הרמטכ"ל כי במסגרת התחקירים יהיו גם נושאי צד שהם לא חלק מארבעה מוקדי התחקירים המטכ"ליים: פינוי חללים, פינוי יישובים, וביטחון מידע שבאחריות אמ"ן ומחוץ לאמ"ן, תחום שהתגלו בו פערים גדול בין הרצוי למה שהתגלה בשטח. בנוסף לכך, מתנהלים במקביל 41 תחקירי יישובים בנגב המערבי בהם שולבו אלופים במילואים, בהם ראש אגף התקשוב לשעבר האלוף ערן ניב, שקיבל על עצמו להוביל את תחקיר נחל עוז. התחקיר היחיד שהוצג הוא על קיבוץ בארי, שגרר אחריו ביקורת חריפה מצד התושבים.
בצה"ל מתעקשים שלא מדובר בגרירת רגליים והציגו לוואלה את תנאי תחקיר קיבוץ בארי שבתחילה הוקצו לו לסיכום 10 שעות ולבסוף נאלצו לסכם את התחקיר ב-21 שעות. עוד הצביעו על כך שתתי-המוקדים בתחקירים מתארכים. כך גם תחקירי קרבות שמוגדרים כמורכבים. "התכנון עוד לא פוגש מציאות...", אמר גורם המצוי בפרטי התחקירים. עוד הבהירו בצה"ל כי בשבועות האחרונים חזרו תהליכי התחקירים להתקדם בחופף ללו"ז המבצעי, אבל ההתפתחויות האחרונות בסוריה ולבנון חזרו לעכב את העבודה.
במקביל, נשמעו טענות מתוך אגף המודיעין, על כך אופי התחקירים והתנהלותם. כאמור, ראש אמ"ן היוצא האלוף אהרון חליוה הניח סיכום תחקיר מסודר, מגובה בהקלטות לרמטכ"ל. בחודשיים האחרונים תחקירים נוספים בתוך אמ"ן החלו לעורר מחלוקת בין מפקדי היחידות וקצינים בכירים.
בצה"ל הבהירו כי אמ"ן משולב בכל אחד מ-18 תתי-המוקדים. למשל, איך הופעלה מערכת התצפיות על רצועת עזה לפני המלחמה ומה השיטה ואחרי מה התבקשו התצפיתניות. סוגיה זו מתוחקרת על ידי מפקד מערך הגנת הגבולות בזרוע היבשה ועל ידי אמ"ן, אוגדת עזה ופיקוד הדרום. בהרבה מובנים, הסבירו, יש חלקים גדולים באחריות אמ"ן שנמצאים בתחקור וטרם הושלמו. כמו אירועי הלילה בין ה-6 ל-7 באוקטובר, ועדיין צריך לתחקר ולתת לגופים אחרים להגיב על התחקיר המרכזי.
עוד טענו בצה"ל כי יש שאלות שהתעוררו תוך כדי התחקירים שגוררות עוד בדיקות. בצה"ל הבהירו כי מסמכי מודיעין של חמאס ואחרים שנתפסו במהלך המלחמה שופכים אור על לא מעט שאלות ותחקירים ולכן בדיקתם והשימוש בהם מעכבים את סיכומי התחקיר. חלק מהמסמכים, בהם על תחקירי פד"ם, תחקירי אוגדת עזה, תחקירי האיסוף קרבי וזרוע יבשה, אותרו אחרי פרישתו של חליוה.
עוד נודע לוואלה כי בתחקיר המטכ"ל נבחנת מערכת היחסים בין בין להק המודיעין בחיל האוויר למספן המודיעין בחיל הים לאמ"ן. במסגרת הבדיקה, עולות סוגיות שלא נדונו עד כה - ולכן, לפני הצגת המסקנות לדרג המדיני ולציבור, כך טוענים בצבא, צריך להשלים את התמונה המלאה.
בנוסף לכך, הוטלה משימה על תא"ל א', מפקד יחידת 9900, לבצע אינטגרציה לכלל התחקירים באמ"ן כדי להבין אלו מחלוקות בין הצדדים על העובדות לא נפתרו ומה צריך להדגיש אותן בפני המטכ"ל. לכן, תחקיר אמ"ן טרם סוכם סופית. יצוין, כי כל הדחיות בלו"ז התחקירים מובאות לאישור הרמטכ"ל.