הפוגרום בהולנד שהתרחש הלילה ברחובות אמסטרדם, מעלה שאלות קשות אודות ההתנהלות הישראלית לפני ואחרי משחק הכדורגל. גורמים במערכת הביטחון אומרים, כי מישהו היה צריך לחשוב כיצד להיערך למשחק לא רק בתגבור האבטחה סביב קבוצת הכדורגל ואנשיה, אלא לקיים הערכת מצב סביב הסיכוי לאירועים אלימים נגד אוהדים ברקע הפגנות התמיכה בהולנד בפלסטינים ברצועת עזה וגם באירופה כולה.
לפי עדויות ראשוניות עולה כי, לא רק שלא תוגברה האבטחה סביב האוהדים הישראלים שהגיעו באלפים למשחק באמסטרדם, נוצר הרושם הראשוני שמשטרת אמסטרדם לא באמת נערכה לתרחיש שכזה.
כמו כן, אף אחד לא מצא לנכון להעביר אזהרות והנחיות מפורשות לאוהדים כיצד לנהוג כשידוע לכל שהם ישהו בקבוצות גדולות ויהיו ניתנות לזיהוי על ידי גורמים אלימים מקומיים פרו פלסטיניים. "עדיין לא ניתן לקבוע בשלב הזה האם מדובר בהתארגנות מובהקת במימון ארגון טרור או אחר או בפעולות ספונטניות שקיבלו הד תקשורתי ברשתות החברתיות ויצרו חקיינות". עוד הוסיפו הגורמים, "אבל מה שבטוח שידוע במערכת הביטחון כי האיראנים כמו ארגוני הטרור חיזבאללה וחמאס יודעים לחבור למקומיים באירופה ובעולם כולל לארגוני פשיעה שכוללים בתוכם מוסלמים על מנת להוציא אל הפועל פעולות טרור, אלימות, הברחות או פעולות לאיסוף מודיעין".
גורמים במערכת הביטחון מציינים כי במיוחד בעת הזו שהאיראנים ושאר ארגוני הטרור מחפשים דרך לנקום בישראל בדרכים מגוונות היה נכון לקיים הערכת מצב משולבת על מנת להיערך לתרחיש שכזה, לא רק בהולנד.
בנוסף לכך, עולות שאלות קשות סביב היערכות משרד הביטחון וצה"ל לתרחיש פינוי אלפי האוהדים שהשתתפו במשחק וחלקם התכוון לשהות ברחבי הולנד עוד מספר ימים כדי להנות מאווירת סוף השבוע ובהתאם קנו כרטיסים ושכרו חדרים בבתי המלון.
גורמי ביטחון אמרו, כי לא רק שהתברר כי הקשר בין גופי הביטחון בישראל להולנד הוא רופף באופן כזה שלא אפשר העברה מהירה של האזרחים לשדה התעופה אלא מחייב הוצאת משלחת של צה"ל לאמסטרדם בלוחות זמנים קצרים.
בנוסף לכך, בהתחלה התקבלה החלטה להוציא שלושה מטוסים של חיל האוויר ולבסוף מטוס אחד שגם הוא לא קיבל אישור ולא ברור כמה אנשי חילוץ והצלה, רפואה ומאגף מבצעים יעלו עליו. בצה"ל הדפו טענות להחלטה פוליטית שנועד לרכב על האירוע וטענו כי ההנחיות להוצאת משלחת הגיעו מהמטכ"ל על בסיס הצעות שהועלו בפיקוד העורף.