עשר שעות לאחר המתקפה המחרידה על ארצות הברית, נאם הנשיא בוש לאומה ממשרדו בבית הלבן. "זהו רצח המוני", אמר בוש. "תמונות המטוס המתרסק מילאו אותנו בצער רב ובכעס שקט ועיקש. אורח חיינו, החופש שלנו הותקף. מזכירות, אנשי צבא, אזרחים, אנשי עסקים, חברים ושכנים אלפי חיים נקטעו באיבם. הפעולה היתה מיועדת לגרום לכאוס, אך הם נכשלו".
הוא הוסיף ואמר: "הצבא שלנו מוכן וחזק. לא נבחין בין הטרוריסטים לבין אלו שנתנו להם מקלט". לדבריו הנחתי את המודיעין "לפעול בכל כוחו כדי למצוא מי עומד מאחורי הפעולה".
"ארה"ב הותקפה בגלל הטוב שבה, ודבר לא יגרום לאור שבה לכבות". אמר בוש. "היינו עדים היום לרוע, לסוג הגרוע ביותר של האנושות ונגיב לזה בכל כוחה של אמריקה, בעזרת שכנינו ובעלי בריתנו... הם יכולים לזעזע את יסודות הבניינים החזקים שלנו, אך לא את יסודותיה האיתנים של אמריקה".
לדברי בוש, מיד לאחר המתקפה הוא הפעיל את תוכניות החירום. "צוותי החירום בניו יורק ובוושינגטון עובדים, במטרה לתת עזרה לנפגעים ולנקוט בכל הצעדים על מנת להגן על אזרחינו בארץ ובעולם".
יחד עם זאת, ציין בוש כי החל מהבוקר יחזרו כל משרדי הממשלה לתפקוד מלא, והודיע כי הכל יפעל כרגיל. "הכלכלה שלנו תישאר יציבה וחזקה ותיפתח גם היא לעסקים" .
"גם כי אלך בגיא צלמוות לא אירא רע כי אתה עימדי", ציטט בוש מזמור מתהילים (פרק כ"ג פסוק ד'). הוא הודה לכל מנהיגי העולם שהציעו עזרה ותנחומים, "בעלי בריתנו חברו אלינו כדי לנצח את המלחמה בטרור".
בסיום נאומו שלח בוש תנחומים והשתתפות בצער למשפחות ההרוגים, הנפגעים "ולכל מי שבטחונו נפגע. לא נשכח את היום הזה", דברי הנשיא בוש.
הפנטגון עבר למצב חירום "דלתא"
רמטכ"ל צבא ארה"ב, גנרל יו שלטון, אמר הערב כי "הכוחות המזויינים של ארה"ב מוכנים לכל התפתחות". גורם בכיר בפנטגון אמר הלילה לסוכנות הידיעות "רויטרס", כי משרד ההגנה הורה לנושאת המטוסים "אנטרפרייז" שלא להפליג לאוקיינוס ההודי כמתוכנן, ייתכן שנושאת המטוסים תידרש לשוב למפרץ הפרסי.
כל כוחות הצבא האמריקני ברחבי העולם עברו לרמת כוננות עליונה. מיד לאחר הפיצוץ עבר הפנטגון למצב חירום "דלתא", שנכנס לתוקף במקרים של איום טרור חמור. בעקבות האירועים, הוכרזה כוננות גבוהה ביותר בכל מתקני הממשל והצבא בארה"ב ובנציגויות ארה"ב בעולם.
לאחר התרסקות המטוסים במגדלי התאומים, הוכרז בניו יורק מצב חירום וכל המרחב האווירי של ארה"ב נסגר לתנועת מטוסים. בעקבות מתקפת הטרור, נמסר על פינוי הבית הלבן, הקונגרס והאו"ם, גורדי שחקים בכל ארה"ב - וכן הפסקת כל הטיסות ברחבי ארה"ב והפנייתן לקנדה.