ליטא פתחה בחקירה פלילית לאור האשמות שבכירים במערכת הביטחון במדינה עזרו לסוכנות הביון המרכזית של ארצות הברית, ה-CIA, לנהל בית כלא סודי במדינה. התובעים החליטו לזנוח את תיק החקירה לפני ארבע שנים אך לאחרונה החליטו לפתוח אותו מחדש בעקבות פרסום של הסנאט האמריקני מהשנה שעברה שכלל פרטים סודיים על מתקני ה-CIA, מבלי לחשוף את מיקומם. הפרטים שחשף הסנאט תאמו לדיווחים על אתר דומה בליטא. הרשויות מעולם לא הודו בקיומו של בית כלא של ה-CIA בליטא, וארצות הברית מעולם לא חשפה את מיקום המתקנים הסודיים, אך הודתה כי בתי כלא כאלו קיימים וכי במקרים מסוימים אף בוצעו שם עינויים.