משרד החקלאות תוקף את הצעתו של משרד האוצר להקמת רשות מים ממשלתית בישראל, וטוען כי היא מנוגדת להחלטת הממשלה מאוגוסט 2004 בנושא.
לטענת המשרד, המודל לרשות המים הוגש לראש הממשלה לפני סיום עבודת ועדת היישום הבין-משרדית, המשותפת לנציבות המים ומשרדי התשתיות, הפנים, איכות הסביבה והאוצר, תוך התעלמות מהנחיית הממשלה ומנימוקי נציג משרד החקלאות בוועדה.
בהחלטת הממשלה באוגוסט אשתקד, נקבע כי על הוועדה הבין-משרדית להציג בפני הממשלה שני מודלים חלופיים לרשות מים - מודל אחד למשק המים כולו, המאחד את כל גורמי המים, ומודל שני המפריד את משק המים לחקלאות ממשק המים האחר. למרות החלטת הממשלה, טוענים במשרד החקלאות, כי משרד האוצר מתעלם לחלוטין ממנה והגיש לממשלה הצעה להקמת רשות מים על פי מודל אחד בלבד, בניגוד גמור לקביעת הממשלה.
הממונה על המים ברשות לתכנון במשרד החקלאות, שי דותן, מוסר כי התנהלות משרד האוצר "תמיט אסון על החקלאות בישראל".
חשש מפגיעה באזורי הפריפריה והעדיפות הלאומית
במשרד החקלאות חוששים, שהקמת רשות מים תשלול סמכויות מהמשרד, ובכך תפגע "באחד הכלים המרכזיים לקיומה ופיתוחה של החקלאות בכל חלקי הארץ, בעיקר באזורי הפריפריה ועדיפות לאומית".
סגן נציב המים לשעבר, צביקי נור, טוען, כי "לקיחת תחומי אחריות ממשרד החקלאות וניהולם על בסיס כלכלי בלבד תמנע מהמשרד את השיקולים הלאומיים ארוכי הטווח".